 1999年7月中国科学院上海生命科学研究院（以下简称为“上海生科院”）应时代潮流的挑战而诞生了。她秉承了中国科学院沪区8个生物学研究机构半个多世纪的优良传统，成为中国科学院知识创新工程首批试点单位之一。
上海生科院的使命是在中国建设一个国际先进水平的“药物与人口健康自主创新核心”，使之成为产出“一流成果、一流效益、一流管理、一流人才”的生命科学研究机构，促进我国生物技术产业发展基地，以及生命科学与生物技术高级人才培养基地。在我国药物与人口健康自主创新体系中发挥骨干引领和示范带动作用，为提高我国疾病防控能力、人民健康水平、促进医药产业发展不断做出基础性、战略性和前瞻性的重大创新贡献。
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